1、提高生物利用度。凡粉碎作业都可在一定量上将中药的细胞打碎，只是粗粉碎作业细胞破壁率低，粉磨粒径比细胞直径越大，破壁率就越低。细胞破壁后，破壁细胞中的内容物可直接接触溶媒，其有效成分可以全部直接进入溶媒被人体吸收，而在一般粉碎颗粒和饮片中多数细胞是完整的，其粒子有数个、数十个甚至根多细胞组成。细胞中的有效成分的溶出需穿过数个甚至数十个细胞才能进入溶媒，而后被人体吸收。而且相当一部分细胞成分不可能穿过细胞壁进入溶媒，这一部分只能白白扔掉。因此，细胞级微粉中药的有效成分释出量和释出速度，单位时间内人体吸收药物有效成份的量都会比普通粉碎方法所获得的中药粉末高，其释出的药物有效成份的种类也要比普通粉碎方法全。药物起效时间会显著缩短，药对人体的作用更全面，作用强度更高。
2、复方粉碎中的匀化作用。中药大部分是复方，复方由各药材组成，细胞破壁后，细胞内的水份及油份迁出，使微粒子表面呈现出半湿润状态，粒子和粒子之间会形成稳定的粒子团（或称之为微颗粒），每一个粒子团都包含相同比例的中药成份。该粒子团的物理结构随组份中各成分的HLB值（亲水、亲油平衡值）、延展性、破碎性、含水（油）率、比重等不同组合和不同的相互作用而不同。这种结构会使中药材各有效成分均匀化，使各种成分均匀的被人体吸收，这也可以增强药物的作用效果。
3、提高有效成份的工业提取率。由于细胞破壁率高，溶出阻力减小，细胞级微粉中药工业上用于提取药物有效成份时会明显提高提取率。有人做过知母中的菝葜皂甙元的提取试验在简化工业操作条件下，提取率提高22.5%。对于大分子成份提取率的提高更为明显。
4、减小口服颗粒感。巧克力研究表明：物料平均粒度25μm左右，且其中大部分颗粒的粒度在15～20μm中间，吃起来就有很好的细腻华润的口感特性，当平均粒度超过40μm时就能明显感到粗糙感。中药复方细胞级粉碎作业后的平均粒度一般在20μ以下，20μ以细占到75%以上，其颗粒度已低于口腔颗粒感觉阈值，因此服用时无粗糙感。
5、附加作用。既然是细胞级粉碎，那么与细胞级尺度相当的虫卵也就会被杀死。从而减轻虫害对中药材的威胁。
